Je to tzv. sandboxová hra, ve které si hráč může dělat, co se mu zachce.
V tomto případě je hráč vrhnut do krychlovitého 3D světa, kde si musí sám nasbírat materiál na stavbu obydlí a na výrobu nástrojů. Ve hře je aplikován efekt dne a noci. V noci se objevují příšery.
Hráč buď může sedět a čekat na svítání, jít ven a bojovat o svůj holý život, jen se snažit rozšířit svůj skromný přístřešek nebo jít spát. Hra obsahuje různé stupně obtížnosti od Peaceful, kdy se neobjevují monstra a životy se automaticky doplňují, až po obtížnost Hard. Hra Minecraft také obsahuje podporu texture packů, které mění vzhled hry. Další z možností okořenění hry je instalace prozatím oficiálně nepodporovaných modifikací, které mohou přidat například nové bloky, zvěř a předměty.
Herní módy:
Survival – původní herní mód (hlad, těžení, přežívání)
Hardcore – stejný jako mód Survival, s nezměnitelnou obtížností Hardcore.
Pokud zemřete, vymaže se celý svět a hra končí.
Creative – herní mód, ve kterém je zpřístupněno neomezené množství věcí zcela bez těžení, s funkcí létání.
Všechny bloky lze rozbít na jedno kliknutí a hráč je v této hře nesmrtelný, ovšem pokud vypadne ze světa (Void), zemře.
Adventure – Stejné jako survival. Nedají se těžit ani pokládat bloky. Předměty se dají ovládat.